一、经济性与安全性的关系。 自主技术创新的第一需要来自于国家安全的迫切要求。自主技术创新需要投入巨额的成本，需要较长的时间，有时在经济性方面算账是不合算的，即自力更生不如花钱购买。然而，一个国家在国防、行政、司法、金融、信息等方面需要所用的技术先进和安全可靠。购买和引进技术面临的问题是：技术拥有者卖给我们的可能是二流和三流的技术，甚至是淘汰的技术。即使国外技术拥有者愿意卖给我国先进技术，使用这些技术装备、软件等也是会使我们的国防体系、行政司法体系、金融体系和整个国家的信息体系处于不安全状态之中。因此，对于事关极其复杂的国际、政治、外交和军事等安全方面的技术，即使成本再高、风险再大，也应在尽可能缩短研发、转化和推广时间的前提下，集中财力、人力和物力，推进这些科技的自主创新。

　　二、技术选择与战略布局的关系。　自主创新战略怎样布局，是所有的技术都齐头并进，还是分层次、有重点地加以突破，这需要认真探讨。保证国家安全方面的技术需要自主创新，节约资源方面的技术需要自主创新，更多更好地利用劳动力资源的适度技术需要在引进转换的基础上创新提高，为达到中等发达国家发展水平的追赶型技术也需要创新，增强国家国际竞争力的尖端赶超型技术则更需要自主创新。因而，需要在财力、组织等各方面进行战略布局。除了涉及国家安全和产业提升方面的技术外，我们既要在世界领先技术领域争得份额，也要花大力气对于我国迫切需要的节约资源的技术进行自主创新。

　　三、短期利益与长期利益的关系。 只有在基础科学研究和基础技术开发方面打牢基础，做好准备，才有能力抓住面临的新一轮技术革命和产业升级的机遇。如果在科学和技术上短视，追求利益的短期化，将会使我们再一次丧失机遇。关于正确认识和处理长远利益与目前利益、基础研究与技术应用方面的关系，在理论上已为大多数人所接受，但在实际排列经济和科技工作顺序时，又往往舍不得将财力、人力、物力投在基础科学研究和基础技术开发上。重大和基础科学的研究和开发往往需要时间很长，见效期较远，地区和部门的领导任届时间有限，现行的干部考核指标体系又无法考核今天科技创新给未来可能带来的绩效。因而，对于基础科学、基础技术和科技推广这样的公共领域，其投入没有体制和制度上的保证。有鉴于此，公共财政中基础科学研究、基础技术开发、重大技术转化和推广等，需要有硬性的支出预算比例来保证。

　　四、技术进步与发挥优势的关系。　一般来说，技术进步加速资本有机构成的提高，因而在产业中是替代和排斥劳动力的。从总体上讲，资本密集型的技术进步推进太快，会形成大量的剩余劳动力，即失业问题;而从国际贸易来看，用我们技术缺乏的短处，而不利用我们劳动力资源丰富和便宜的长处去参与国际市场竞争，正好是扬短避长，会得不偿失。然而，我们又要推进科技自主创新，怎么办？需要特别指出的是，我们不能用简单的劳动力密集优势，而是要用劳动密集性的技术进步参与全球化竞争。

　　五、自主创新与参与全球化的关系。　新的世界贸易格局中，对国内产业的保护单靠高关税、配额管理、币值高估等为办法已无法实现。发达国家在产品生产和贸易中以自主的技术为基础制定了许多产品和服务标准，这些标准对发展中国家的产品和服务形成技术壁垒，规避了发展中国家低成本商品的竞争，客观上保护了发达国家自己的产业，而发展中国家的产业却深受其害。技术是标准的基础，只有拥有自主创新的技术，才能制定自主的标准，进而让国外产品和服务适应中国标准。因此，要鼓励技术自主创新，促进技术专利的形成和增加。另外，在政府的引导下，发育和发展行业协会，由行业协会学习借鉴国外的技术标准，根据自主的技术和工艺，考虑中国国情，制定自己的产业、产品和服务标准，改善国内产品和服务在国内市场上的竞争条件。

　　六、科技创新与人才战略的关系。　现代教育是科学技术转化为生产力的基础，是科技第一生产力由“潜在性”变为“现实性”的前提和条件。教育是人才之本，而人才则是科技自主创新的基础。要培养出科技创新人才，就必须进行教育方式的改革，开展创新式教育，改应试教育为素质教育，允许学生不同观点、不同见解的存在和讨论，鼓励学生的个性得到发挥，激活学生的思维，开启和培养其创新思维能力。科技自主创新战略，基础是科技自主创新人才战略。从层次上讲，我们要有从事创新型基础科学研究的人才，要有发明创新技术的人才，要有转换和应用创新技术的人才，要有模仿和提高引进技术的人才。从渠道上讲，我们既要重视国内培养，发挥各大专院校、研究所、企业研发中心、博士后流动站等的作用，培养大量的本土化的创新人才;还要积极创造条件，吸引国外学有成就的创新型人才回国，带来国外的先进科学知识和技术，并与中国国情相结合，为整个国家的科技创新战略服务。

　　七、自主创新与引进消化的关系。　需要指出的是，科技自主创新不等于闭关自守。我们需要开放，需要引进和学习国外的先进技术，将其模仿、消化和吸收，为我所用。此外，在消化吸收的基础上，进一步进行技术创新。即引进后学习，学习后应用和转化，应用后自主提高。在引进、学习、消化和吸收方面需要注意解决三个问题：一是许多引进项目，由于种种原因，部分引进的技术装备陈旧、价格奇高、后续技术断裂，不但使技术没有消化吸收，而且浪费巨额外汇;二是引进技术后，不重视消化吸收，引进与消化吸收脱节，更不重视在此基础上自主创新和提高技术，使一些同类的产业需要重复引进国外技术和装备，并依赖国外的后续服务技术，使设备和技术运转成本很高;三是盲目排外，封闭研究和开发，拒绝引进和学习国外的技术。只有解决好这三个问题，我们才能处理好科技自主创新与引进、学习、消化和吸收的关系。

　　八、政府作用与市场调节的关系。　自主创新中，政府的主要职能为研究和公布长期的科技自主创新战略，保证和增加基础科学和重大科技进步项目的投入，对重大的基础科学研究项目和重大的技术创新项目组织国家研究和发展体系，制定各项科技自主创新的财政、税收、人才、产业等政策，对政府各部门出台的科技促进政策进行协调，对一些重大的项目组织联合攻关，督促和引导行业协会制定各种技术标准，制定保护知识产权的法律和法规，监管专利和技术市场等等。在科技自主创新中，政府既不能越位，不能代替企业进行一些技术的自主创新，不能代替市场进行调节，也不能缺位。

　　企业、中介和市场，是技术转换为生产和服务能力的最有效机制。跨国公司、特大型企业，是科技自主创新、转化、应用和推广的主体。国家要正确处理垄断与竞争的关系，对一些产业适当地提高集中度，使其获得规模扩大带来的收益递增，并监督其利润对科技创新投入的比例。国家要在税收优惠、贷款贴息等方面对企业科技自主创新的项目进行支持。从资金上看，除了形成国家科技创新基金外，还要鼓励各类科技风险投资基金、科技创新担保公司、国家科技创新风险基金等等的成立、发育和发展，形成科技自主创新的全社会投入体系。

　　就科技市场体系看，要建立专利和技术的交易市场，从专利申请、技术价格评估、技术入股的谈判协商、知识产权保护等方面，形成完备的创新技术市场。由技术市场的供求来评估技术的价值，多个技术供给者竞价降低技术的开发成本，由市场的不同和新的需求来调节对各类技术的最优投入。要放开资源的价格，促进创新型的技术进步更好地发展。